برخی از عفونت‌هایی که در بدن ایجاد می‌شوند، به دلیل وجود باکتری‌ها، قارچ‌ها و ویروس‌ها در بدن ایجاد می‌شوند. عفونت‌های ناحیه ادراری، تناسلی و خونی از شایع‌ترین عفونت‌های بدن هستند که به واسطه انواع باکتری‌ها و سایر عوامل خارجی ایجاد می‌شوند.
برای تشخیص این عفونت‌ها، به طور معمول، از کشت ادرار و یا خون استفاده می‌شود و در مواردی مشاهده بافت موضعی در زیر میکروسکوپ‌ها می‌تواند وجود این عوامل خارجی را تشخیص دهد.
